Migrena podstawna jest specyficzna. Podczas aury występują objawy sugerujące zmiany w tylnej jamie czaszki. Potem pojawia się ból głowy zlokalizowany w potylicy o charakterze pulsującym. Jest to rzadki wariant migreny, zwykle dotyka dziewczynek i młodych kobiet. Bardzo rzadko pojawia się u chłopców, zawsze wtedy należy zastanowić nad rozpoznaniem. Kiedyś ta migrena nazywana była migreną tętnicy podstawnej. Nie udowodniono jednak udziału tętnicy podstawnej w tym typie migreny, dlatego obecnie nazywa się migreną podstawną. Do zachorowania dochodzi zwykle równocześnie z rozpoznaniem migreny z aurą.
Aby stwierdzić migrenę podstawną należy wykazać obecność takich objawów jak:
- afazja (zaburzenia mowy),
- dyzatria (problemy z artykulacją),
- zawroty głowy,
- szumy uszne,
- zaburzenia widzenia,
- niezborność,
- zaburzenia czucia,
- zaburzenia świadomości,
- obustronne parestezje (mrowienia).
Objawy narastają powoli (co ułatwia zróżnicowane migreny z udarem, gdzie objawy pojawiają się nagle) a następnie ustępują całkowicie. Ważne jest to, że w tym typie migreny nie ma osłabienia siły mięśniowej. A objawy aury muszą trwać co najmniej 5 minut. Czasami występują napady padaczkowe, pacjent zwykle pamięta przebieg napadu.
Po napadzie migreny można zauważyć zmęczenie, rozdrażnienie, zaburzenia uwagi, zmiany nastroju. Jeśli po aurze nie występuje ból głowy należy przeprowadzić badania obrazowe.